Όλες οι αποστολές του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης – ΠΚ, που αφορούν στη μελέτη και στην προστασία του κρητικού περιβάλλοντος, αλλά και του ευρύτερου ελληνικού χώρου και της ανατολικής Μεσογείου, τεκμηριώνονται φωτογραφικά εμπλουτίζοντας το φωτογραφικό αρχείο του μουσείου.
Το φωτογραφικό αρχείο του μουσείου ξεκίνησε τη λειτουργία του το 1990 και έκτοτε βρίσκεται σε συνεχή εξέλιξη αυξάνοντας την ποσότητα του υλικού του. Τα τελευταία χρόνια οι διαφάνειες ψηφιοποιούνται, προσδιορίζονται από τους ερευνητές του ΜΦΙΚ και καταχωρούνται ηλεκτρονικά σε βάση δεδομένων, με πάνω από 10 λέξεις κλειδιά για την κάθε εγγραφή, γεγονός που διευκολύνει την αναζήτησή τους και οδηγεί στην καλύτερη αξιοποίηση του πολύτιμου αυτού υλικού.
Μέχρι τώρα αριθμεί, περίπου, 133.000 εγγραφές περιβαλλοντικού περιεχομένου (41.600 διαφάνειες, 2.500 αρνητικά και 89.000 ψηφιακές φωτογραφίες).
Οι φωτογραφίες προέρχονται, κυρίως, από τις αποστολές των ερευνητών του ΜΦΙΚ στην Ελλάδα και στην Ανατολική Μεσόγειο (εικόνες ζώων, φυτών, απολιθωμάτων, βλάστησης και γενικότερου τοπίου), από εξειδικευμένες μακρο-φωτογραφίσεις στούντιο (πχ. μικροσκοπικοί οργανισμοί, απολιθώματα, κλπ.) και από λήψεις στα πλαίσια ερευνητικών προγραμμάτων του μουσείου. Επίσης, είναι καταχωρημένες εικόνες ανθρώπινων δραστηριοτήτων στη φύση, ενώ με εκτενές αρχείο καλύπτονται και οι εκπαιδευτικές δραστηριότητες του μουσείου.
Το αρχείο υποστηρίζει, επίσης, το Γραφιστικό Τμήμα του ΜΦΙΚ για την υλοποίηση όλων των εκδόσεων και των εντύπων, καθώς και για τη διαμόρφωση των μόνιμων ή περιοδικών εκθέσεών του.