Οργανόγραμμα

Το Μουσείο Φυσικής Ιστορία Κρήτης είναι οργανωμένο σε 7 Εφορίες:

1. Βοτανικής
2. Γεωποικιλότητας
3. Παλαιοντολογίας
4. Σπονδυλωτών
5. Ασπονδύλων (εκτός Αρθροπόδων)
6. Αρθροπόδων
7. Γενωμικής και Γενετικών Πόρων

διαθέτει δύο Εργαστηριακές μονάδες:

1. Εκπαίδευσης
2. Οικολογίας – Διαχείρισης Περ/ντος

και διατηρεί μόνιμο εκθεσιακό – εκπαιδευτικό χώρο στη Λεωφόρο Σοφοκλή Βενιζέλου (Κόλπος Δερματά) στο παραλιακό μέτωπο της πόλης του Ηρακλείου.